Para adelantar las investigaciones por delitos contra personas defensoras de derechos humanos, personas reincorporadas y población civil la Unidad Especial de Investigación elaboró una metodología de investigación propia que se compone de tres etapas:
- Avances investigativos que corresponden al esclarecimiento de los hechos victimizantes abordados por la Unidad Especial.
- La sostenibilidad en el cual se desarrolla un proceso investigativo y analítico para la caracterización probatoria de una organización criminal en sus tres dimensiones (estructura militar, estructura financiera y mecanismos de control de la población) partiendo del esclarecimiento de homicidios y la asociación de hechos (amenazas, desplazamientos y desapariciones forzados, extorsiones, entre otras conductas delictuales).
- La consolidación, a través de la cual, se parte de la identificación de objetivos estratégicos más allá de la estructura militar (redes de apoyo) para atribuir responsabilidad penal a los integrantes de una organización criminal según su participación, posición y rol al interior de la organización criminal buscando su desarticulación como aporte al desmantelamiento.
A partir de esta metodología y la distribución de los equipos de la Unidad en las zonas con mayor afectación contra poblaciones específicas como defensores de derechos humanos y personas en proceso de reincorporación de las Farc-EP se cumple con el mandato establecido por el decreto ley 898 de 2017.
A partir de las etapas de sostenibilidad y consolidación de la metodología de investigación implementada por la Unidad Especial de Investigación se han estructurado proyectos de investigación que tiene como principal objetivo impactar estratégicamente aquellas organizaciones criminales que victimizan poblaciones específicas como los defensores de derechos humanos y personas en proceso de reincorporación y esclarecer afectaciones contra la población civil.
El propósito general de los Proyectos es impactar, de manera estratégica, a las organizaciones criminales responsables de las graves afectaciones contra la población priorizada (reincorporados de las Farc, sus familiares y defensores de derechos humanos) y de competencia de la Unidad Especial de Investigación asociando a estas situaciones: homicidios, desplazamiento forzado, desaparición forzada y las amenazas producidas por estas mismas organizaciones contra la población en general en los territorios.
